1. Lembaga Pembinaan Pendidikan Al Qur’an (LPPA)
2. Lembaga Pembinaan Pendidikan Dasar (LPPD) Pesantren Baitul Qur’an
3. Lembaga Pemeliharaan dan Perluasan Wakaf Baitul Qur’an (LPPWBQ)
4. Lembaga Dana Sosial Baitul Qur’an (LDSBQ)
5. Learning Centre Baitul Qur’an (LCBQ)